Synopsis :
Le major Motoko Kusanagi est un brillant officier de la force de sécurité de la section 9. Elle est un agent cybernétique, aux caractéristiques profondément modifiées. Avec son ami Batou, un Cyborg, et de l'humanoïde Togusa, Kusanagi se lance à la poursuite du Puppet Master, redoutable voleur de données capable de s'infiltrer dans la conscience de ses victimes. Ses marionnettes humaines, inconsciemment, commettent des actes criminels pour leur maître, dissimulé dans l'obscurité. Et lorsque le ministère des Affaires Etrangères, la mystérieuse section 6, entre en scène, Kusanagi comprend que son adversaire invisible est au centre d'une vaste conspiration politique.